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Cabe destacar que el actor fue educado en la tradición judía por su madre, y al mismo tiempo en la cristiana por su padre, y pasó tanto el bar mitzvah como el bautismo. Shaya LaBeouf admitió en una entrevista que se sintió atraído por el catolicismo debido a su propio alcoholismo y a las dificultades de su vida personal.
Según el actor, fue tutelado por Mel Gibson, que le introdujo en diversos ritos católicos, como la misa.